| Groupe A | 20.08.2016 | Sporting Cristal | - | Unión Comercio | 1:0 |  |
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| Groupe A | 25.08.2016 | Unión Comercio | - | FBC Melgar | 0:0 | ||||
| Groupe A | 11.09.2016 | Universidad Cesar Vallejo | - | Unión Comercio | 0:1 | ||||
| Groupe A | 17.09.2016 | Unión Comercio | - | Juan Aurich | 2:2 | ||||
| Groupe A | 25.09.2016 | Unión Comercio | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Groupe A | 28.09.2016 | Real Garcilaso | - | Unión Comercio | 1:0 | |
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| Groupe A | 16.10.2016 | Unión Comercio | - | Defensor La Bocana | 1:1 | ||||
| Groupe A | 19.10.2016 | Unión Comercio | - | Sporting Cristal | 2:0 | ||||
| Groupe A | 24.10.2016 | FBC Melgar | - | Unión Comercio | 1:0 | ||||
| Groupe A | 28.10.2016 | Unión Comercio | - | Universidad Cesar Vallejo | 3:1 | |
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| Groupe A | 19.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Unión Comercio | 2:0 | ||||
| Groupe A | 23.11.2016 | Unión Comercio | - | Real Garcilaso | 0:0 | ||||
| Groupe A | 27.11.2016 | Defensor La Bocana | - | Unión Comercio | 3:3 | |
Pérou