| 10. Journée | 06.09.2008 | Sportfreunde Lotte | - | FC Schalke 04 II | 0:1 | ||||
| 4. Journée | 13.09.2008 | 1. FC Kleve | - | FC Schalke 04 II | 3:2 | ||||
| 6. Journée | 27.09.2008 | Bayer Leverkusen II | - | FC Schalke 04 II | 0:2 | ||||
| 11. Journée | 02.11.2008 | SC Verl | - | FC Schalke 04 II | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | SV 07 Elversberg | - | FC Schalke 04 II | 4:1 | ||||
| 25. Journée | 04.04.2009 | FC Schalke 04 II | - | FSV Oggersheim | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 17.04.2009 | Borussia Dortmund II | - | FC Schalke 04 II | 4:2 | ||||
| 28. Journée | 02.05.2009 | FC Schalke 04 II | - | SC Verl | 2:3 | ||||
| 29. Journée | 10.05.2009 | 1. FC Kaiserslautern II | - | FC Schalke 04 II | 4:1 | ||||
| 30. Journée | 13.05.2009 | FC Schalke 04 II | - | VfL Bochum II | 0:4 |  |
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