| 22. Journée | 01.02.2020 | Bayern München II | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 23. Journée | 08.02.2020 | Viktoria Köln | - | Bayern München II | 2:4 |  |
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| 24. Journée | 17.02.2020 | Bayern München II | - | Hallescher FC | 6:1 |  |
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| 25. Journée | 24.02.2020 | Chemnitzer FC | - | Bayern München II | 1:0 | |
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| 26. Journée | 28.02.2020 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München II | 0:1 | ||||
| 27. Journée | 07.03.2020 | Bayern München II | - | SG Sonnenhof Großaspach | 2:0 | ||||
| 28. Journée | 30.05.2020 | FC Ingolstadt 04 | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 29. Journée | 03.06.2020 | Bayern München II | - | Preußen Münster | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 06.06.2020 | Eintracht Braunschweig | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 09.06.2020 | Bayern München II | - | FSV Zwickau | 2:0 | ||||
| 32. Journée | 14.06.2020 | Waldhof Mannheim | - | Bayern München II | 2:3 | ||||
| 33. Journée | 17.06.2020 | Bayern München II | - | SV Meppen | 5:1 | ||||
| 35. Journée | 24.06.2020 | Bayern München II | - | TSV 1860 München | 2:1 | ||||
| 37. Journée | 01.07.2020 | Bayern München II | - | MSV Duisburg | 2:2 | ||||
| 38. Journée | 04.07.2020 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München II | 1:0 |
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