| 4. Journée | 21.09.1998 | Aris Saloniki | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 27.09.1998 | Panionios GSS | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 3:0 |  |
|||
| 6. Journée | 04.10.1998 | AO Kavala | - | Panionios GSS | 1:5 | ||||
| 9. Journée | 08.11.1998 | Panionios GSS | - | OFI Heraklion | 0:1 | ||||
| 11. Journée | 29.11.1998 | Panionios GSS | - | Paniliakos Pyrgos | 5:2 | |
|||
| 12. Journée | 06.12.1998 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 13.12.1998 | Panionios GSS | - | AO Proodeftiki | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 21.12.1998 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 15. Journée | 16.01.1999 | Panionios GSS | - | Ethnikos Asteras | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 14.02.1999 | Panionios GSS | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 22. Journée | 08.03.1999 | Panelefsiniakos Elefsinas | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 29. Journée | 08.05.1999 | Panionios GSS | - | Iraklis Saloniki | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 13.05.1999 | AO Proodeftiki | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 16.05.1999 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||||
| 32. Journée | 19.05.1999 | Ethnikos Asteras | - | Panionios GSS | 2:2 | ||||
| 33. Journée | 23.05.1999 | Panionios GSS | - | Olympiakos Piraeus | 1:4 | |
Grèce