| 1. Journée | 11.08.2002 | Eintracht Frankfurt | - | FC St. Pauli | 4:0 | ||||
| 2. Journée | 18.08.2002 | FC St. Pauli | - | LR Ahlen | 1:4 | ||||
| 3. Journée | 23.08.2002 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli | 6:0 | ||||
| 5. Journée | 15.09.2002 | 1. FC Union Berlin | - | FC St. Pauli | 4:2 | ||||
| 7. Journée | 27.09.2002 | Waldhof Mannheim | - | FC St. Pauli | 2:5 | ||||
| 8. Journée | 04.10.2002 | FC St. Pauli | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | ||||
| 13. Journée | 18.11.2002 | FC St. Pauli | - | 1. FC Köln | 2:3 | ||||
| 14. Journée | 24.11.2002 | Wacker Burghausen | - | FC St. Pauli | 1:1 |  |
|||
| 15. Journée | 02.12.2002 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 1:2 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2002 | MSV Duisburg | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 17. Journée | 13.12.2002 | FC St. Pauli | - | Alemannia Aachen | 1:4 | ||||
| 18. Journée | 24.01.2003 | FC St. Pauli | - | Eintracht Frankfurt | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 02.02.2003 | LR Ahlen | - | FC St. Pauli | 3:2 | ||||
| 23. Journée | 28.02.2003 | 1. FSV Mainz 05 | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 16.03.2003 | Rot-Weiß Oberhausen | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 26. Journée | 21.03.2003 | FC St. Pauli | - | SSV Reutlingen | 1:2 |
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