| 1. Journée | 13.08.1999 | Energie Cottbus | - | Fortuna Köln | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 19.09.1999 | Hannover 96 | - | Fortuna Köln | 3:1 | ||||
| 12. Journée | 19.11.1999 | Fortuna Köln | - | Stuttgarter Kickers | 1:1 |  |
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| 13. Journée | 27.11.1999 | VfL Bochum | - | Fortuna Köln | 3:0 | ||||
| 14. Journée | 05.12.1999 | Fortuna Köln | - | TeBe Berlin | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 12.12.1999 | Bor. Mönchengladbach | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 15.12.1999 | Fortuna Köln | - | Waldhof Mannheim | 1:5 |  |
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| 17. Journée | 19.12.1999 | Kickers Offenbach | - | Fortuna Köln | 4:3 | |
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| 18. Journée | 13.02.2000 | Fortuna Köln | - | Energie Cottbus | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 20.02.2000 | 1. FSV Mainz 05 | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 20. Journée | 27.02.2000 | Fortuna Köln | - | 1. FC Nürnberg | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 03.03.2000 | Chemnitzer FC | - | Fortuna Köln | 2:1 | ||||
| 22. Journée | 12.03.2000 | Fortuna Köln | - | Hannover 96 | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 19.03.2000 | Karlsruher SC | - | Fortuna Köln | 2:1 | |
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| 24. Journée | 26.03.2000 | Fortuna Köln | - | Alemannia Aachen | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 02.04.2000 | FC St. Pauli | - | Fortuna Köln | 0:0 |
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