| 1. Journée | 17.03.2006 | FK Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 2. Journée | 26.03.2006 | FK Amkar Perm | - | Zenit St. Petersburg | 1:3 |  |
|||
| 3. Journée | 31.03.2006 | Torpedo Moskva | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 4. Journée | 09.04.2006 | FK Amkar Perm | - | Dinamo Moskva | 3:2 | ||||
| 5. Journée | 16.04.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 22.04.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 7. Journée | 30.04.2006 | FK Saturn | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 28. Journée | 07.07.2006 | Spartak Moskva | - | FK Amkar Perm | 4:1 | ||||
| 10. Journée | 12.07.2006 | Krylia Sovetov | - | FK Amkar Perm | 6:1 | ||||
| 11. Journée | 16.07.2006 | FK Amkar Perm | - | Luch-Energiya Vladivostok | 0:0 | ||||
| 13. Journée | 29.07.2006 | FK Amkar Perm | - | Spartak Moskva | 1:3 | ||||
| 20. Journée | 24.09.2006 | FK Amkar Perm | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 30.09.2006 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 1:3 | ||||
| 22. Journée | 14.10.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Saturn | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 04.11.2006 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Amkar Perm | 3:1 | |
|||
| 27. Journée | 08.11.2006 | FK Amkar Perm | - | Spartak Nalchik | 1:0 |
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