| 5. Journée | 27.08.2016 | Exeter City | - | Portsmouth FC | 0:1 | ||||
| 6. Journée | 03.09.2016 | Portsmouth FC | - | Crawley Town | 3:0 |  |
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| 7. Journée | 10.09.2016 | Portsmouth FC | - | Wycombe Wanderers | 4:2 | ||||
| 8. Journée | 17.09.2016 | Accrington Stanley | - | Portsmouth FC | 1:0 | |
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| 9. Journée | 24.09.2016 | Portsmouth FC | - | Barnet FC | 5:1 | ||||
| 10. Journée | 27.09.2016 | Blackpool FC | - | Portsmouth FC | 3:1 | ||||
| 13. Journée | 15.10.2016 | Plymouth Argyle | - | Portsmouth FC | 2:2 | ||||
| 14. Journée | 22.10.2016 | Portsmouth FC | - | Notts County | 1:2 | ||||
| 15. Journée | 29.10.2016 | Cambridge United | - | Portsmouth FC | 0:1 | ||||
| 27. Journée | 07.03.2017 | Crawley Town | - | Portsmouth FC | 0:2 | ||||
| 38. Journée | 18.03.2017 | Stevenage FC | - | Portsmouth FC | 3:0 | ||||
| 39. Journée | 25.03.2017 | Portsmouth FC | - | Newport County | 2:1 |
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