| 1. Journée | 13.08.2006 | MSV Duisburg | - | TuS Koblenz | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 13.10.2006 | MSV Duisburg | - | SC Freiburg | 1:1 |  |
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| 8. Journée | 20.10.2006 | SpVgg Greuther Fürth | - | MSV Duisburg | 3:5 |  |
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| 14. Journée | 24.11.2006 | MSV Duisburg | - | FC Carl Zeiss Jena | 4:0 | ||||
| 15. Journée | 04.12.2006 | 1. FC Köln | - | MSV Duisburg | 1:3 | |
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| 16. Journée | 10.12.2006 | MSV Duisburg | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 17. Journée | 17.12.2006 | Rot-Weiss Essen | - | MSV Duisburg | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 28.01.2007 | MSV Duisburg | - | SpVgg Unterhaching | 4:2 | ||||
| 20. Journée | 02.02.2007 | Erzgebirge Aue | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 12.02.2007 | MSV Duisburg | - | Karlsruher SC | 2:1 | ||||
| 24. Journée | 04.03.2007 | SC Freiburg | - | MSV Duisburg | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 18.03.2007 | MSV Duisburg | - | Wacker Burghausen | 3:4 | ||||
| 27. Journée | 02.04.2007 | 1. FC Kaiserslautern | - | MSV Duisburg | 0:3 | ||||
| 31. Journée | 27.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena | - | MSV Duisburg | 3:3 | ||||
| 32. Journée | 07.05.2007 | MSV Duisburg | - | 1. FC Köln | 1:3 | ||||
| 33. Journée | 13.05.2007 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 0:3 |
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