| 18. Journée | 09.02.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:3 |  |
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| 19. Journée | 15.02.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Paradiso | 0:0 | ||||
| 20. Journée | 23.02.2025 | SR Delémont | - | FC Rapperswil-Jona | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 01.03.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | Vevey-Sports | 3:0 | ||||
| 22. Journée | 08.03.2025 | FC Bulle | - | FC Rapperswil-Jona | 1:2 | ||||
| 23. Journée | 15.03.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | BSC Young Boys II | 3:1 | ||||
| 29. Journée | 19.04.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Zürich II | 3:0 | ||||
| 30. Journée | 26.04.2025 | SC Kriens | - | FC Rapperswil-Jona | 1:5 | ||||
| 31. Journée | 03.05.2025 | FC Luzern II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:2 |
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