| 1. Journée | 16.08.2008 | SV Babelsberg 03 | - | VfB Lübeck | 1:0 |  |
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| 2. Journée | 23.08.2008 | VfB Lübeck | - | Hallescher FC | 0:1 | ||||
| 4. Journée | 13.09.2008 | VfB Lübeck | - | Hertha BSC II | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 20.09.2008 | VfL Wolfsburg II | - | VfB Lübeck | 1:1 | |
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| 6. Journée | 28.09.2008 | VfB Lübeck | - | VFC Plauen | 2:1 | ||||
| 8. Journée | 18.10.2008 | VfB Lübeck | - | Hansa Rostock II | 3:3 | ||||
| 13. Journée | 15.11.2008 | VfB Lübeck | - | Türkiyemspor Berlin | 3:0 | ||||
| 15. Journée | 30.11.2008 | VfB Lübeck | - | Chemnitzer FC | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2008 | Hannover 96 II | - | VfB Lübeck | 0:0 | |
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| 17. Journée | 14.12.2008 | VfB Lübeck | - | Holstein Kiel | 1:3 | ||||
| 18. Journée | 20.12.2008 | VfB Lübeck | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 | |
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| 19. Journée | 22.02.2009 | Hallescher FC | - | VfB Lübeck | 0:0 | ||||
| 20. Journée | 28.02.2009 | VfB Lübeck | - | Hamburger SV II | 1:0 | |
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| 22. Journée | 14.03.2009 | VfB Lübeck | - | VfL Wolfsburg II | 1:1 |  |
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| 25. Journée | 11.04.2009 | Hansa Rostock II | - | VfB Lübeck | 1:1 | ||||
| 26. Journée | 18.04.2009 | SV Wilhelmshaven | - | VfB Lübeck | 2:1 | |
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| 27. Journée | 25.04.2009 | VfB Lübeck | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 |  |
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