| 20. Journée | 05.02.2016 | SV Sandhausen | - | SC Paderborn 07 | 1:0 |  |
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| 21. Journée | 12.02.2016 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:4 | ||||
| 22. Journée | 21.02.2016 | Arminia Bielefeld | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 26.02.2016 | SC Paderborn 07 | - | RB Leipzig | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 01.03.2016 | Karlsruher SC | - | SC Paderborn 07 | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 05.03.2016 | SC Paderborn 07 | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:1 | ||||
| 26. Journée | 11.03.2016 | FC St. Pauli | - | SC Paderborn 07 | 3:4 | |
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| 27. Journée | 18.03.2016 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 08.04.2016 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Union Berlin | 0:4 | ||||
| 32. Journée | 29.04.2016 | SC Paderborn 07 | - | SC Freiburg | 1:2 | ||||
| 33. Journée | 08.05.2016 | TSV 1860 München | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | |
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| 34. Journée | 15.05.2016 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Nürnberg | 0:1 |
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