| 21. Journée | 08.03.2004 | 1. FC Köln II | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | ||||
| 22. Journée | 12.03.2004 | FC Schalke 04 II | - | Werder Bremen II | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 20.03.2004 | VfR Neumünster | - | FC Schalke 04 II | 2:3 | ||||
| 24. Journée | 27.03.2004 | FC Schalke 04 II | - | KFC Uerdingen 05 | 1:1 |  |
|||
| 20. Journée | 30.03.2004 | FC Schalke 04 II | - | Sachsen Leipzig | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 03.04.2004 | Eintracht Braunschweig | - | FC Schalke 04 II | 2:2 | |
|||
| 26. Journée | 10.04.2004 | FC Schalke 04 II | - | SG Wattenscheid 09 | 2:2 | ||||
| 27. Journée | 16.04.2004 | FC St. Pauli | - | FC Schalke 04 II | 2:0 | ||||
| 28. Journée | 23.04.2004 | FC Schalke 04 II | - | Dynamo Dresden | 2:1 | ||||
| 29. Journée | 01.05.2004 | Wuppertaler SV | - | FC Schalke 04 II | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 09.05.2004 | FC Schalke 04 II | - | Hamburger SV II | 2:3 | ||||
| 31. Journée | 15.05.2004 | Holstein Kiel | - | FC Schalke 04 II | 4:2 | ||||
| 32. Journée | 22.05.2004 | FC Schalke 04 II | - | Rot-Weiss Essen | 0:7 | ||||
| 33. Journée | 30.05.2004 | Chemnitzer FC | - | FC Schalke 04 II | 0:6 | ||||
| 34. Journée | 05.06.2004 | FC Schalke 04 II | - | SC Paderborn 07 | 2:4 |
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