| 8. Journée | 23.09.2006 | 1. FC Slovácko | - | 1. FC Brno | 0:0 |  |
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| 9. Journée | 01.10.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Slovácko | 2:1 |  |
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| 10. Journée | 15.10.2006 | FK SIAD Most | - | 1. FC Slovácko | 2:0 | ||||
| 11. Journée | 23.10.2006 | 1. FC Slovácko | - | AC Sparta Praha | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2006 | SK Kladno | - | 1. FC Slovácko | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 04.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | Viktoria Plzeň | 0:2 | |
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| 14. Journée | 12.11.2006 | FK Marila Příbram | - | 1. FC Slovácko | 1:1 | ||||
| 15. Journée | 18.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | FK Jablonec 97 | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 26.11.2006 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Slovácko | 2:2 | ||||
| 17. Journée | 02.12.2006 | 1. FC Slovácko | - | Tescoma Zlín | 0:0 |
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