| 1. Journée | 31.07.1998 | FC St. Pauli | - | TeBe Berlin | 1:0 | ||||
| 2. Journée | 09.08.1998 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC St. Pauli | 1:0 |  |
|||
| 3. Journée | 13.08.1998 | FC St. Pauli | - | SG Wattenscheid 09 | 1:0 | |
|||
| 4. Journée | 17.08.1998 | Karlsruher SC | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 24.08.1998 | FC St. Pauli | - | Arminia Bielefeld | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 14.09.1998 | 1. FC Köln | - | FC St. Pauli | 1:4 | ||||
| 7. Journée | 20.09.1998 | FC St. Pauli | - | SpVgg Unterhaching | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 27.09.1998 | Hannover 96 | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 11. Journée | 25.10.1998 | FC Gütersloh | - | FC St. Pauli | 1:4 | ||||
| 14. Journée | 15.11.1998 | FC St. Pauli | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 20.11.1998 | Fortuna Düsseldorf | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
| 16. Journée | 01.12.1998 | FC St. Pauli | - | KFC Uerdingen 05 | 2:3 |  |
|||
| 17. Journée | 22.02.1999 | Stuttgarter Kickers | - | FC St. Pauli | 1:3 | ||||
| 20. Journée | 26.02.1999 | SG Wattenscheid 09 | - | FC St. Pauli | 4:2 | |
|
||
| 18. Journée | 04.03.1999 | TeBe Berlin | - | FC St. Pauli | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 07.03.1999 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 1:0 | |
|||
| 22. Journée | 12.03.1999 | Arminia Bielefeld | - | FC St. Pauli | 0:0 | |
Allemagne