| 1. Journée | 15.08.2008 | Sportfreunde Lotte | - | Rot-Weiss Essen | 1:4 |  |
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| 3. Journée | 30.08.2008 | Sportfreunde Lotte | - | 1. FC Kleve | 0:3 | ||||
| 4. Journée | 13.09.2008 | Bor. Mönchengladbach II | - | Sportfreunde Lotte | 2:2 | ||||
| 5. Journée | 20.09.2008 | Sportfreunde Lotte | - | Bayer Leverkusen II | 2:2 |  |
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| 9. Journée | 25.10.2008 | SC Verl | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 | |
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| 12. Journée | 08.11.2008 | Sportfreunde Lotte | - | VfL Bochum II | 4:2 | ||||
| 11. Journée | 11.11.2008 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Sportfreunde Lotte | 3:1 | ||||
| 13. Journée | 15.11.2008 | 1. FC Köln II | - | Sportfreunde Lotte | 0:2 | ||||
| 14. Journée | 02.12.2008 | Sportfreunde Lotte | - | Eintracht Trier | 5:3 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2008 | Sportfreunde Lotte | - | Wormatia Worms | 1:1 | |
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| 17. Journée | 12.12.2008 | Preußen Münster | - | Sportfreunde Lotte | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 16.12.2008 | BV Cloppenburg | - | Sportfreunde Lotte | 3:2 | ||||
| 18. Journée | 19.12.2008 | Rot-Weiss Essen | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 | |
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| 19. Journée | 21.02.2009 | Sportfreunde Lotte | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 14.03.2009 | Bayer Leverkusen II | - | Sportfreunde Lotte | 0:1 | |
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