| 15. Journée | 22.11.2015 | SC Freiburg | - | SC Paderborn 07 | 4:1 | ||||
| 16. Journée | 28.11.2015 | SC Paderborn 07 | - | TSV 1860 München | 4:4 |  |
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| 20. Journée | 05.02.2016 | SV Sandhausen | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 21.02.2016 | Arminia Bielefeld | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | |
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| 23. Journée | 26.02.2016 | SC Paderborn 07 | - | RB Leipzig | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 01.03.2016 | Karlsruher SC | - | SC Paderborn 07 | 0:0 | |
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| 26. Journée | 11.03.2016 | FC St. Pauli | - | SC Paderborn 07 | 3:4 |  |
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| 27. Journée | 18.03.2016 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 28. Journée | 01.04.2016 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 2:1 | |
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| 29. Journée | 08.04.2016 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Union Berlin | 0:4 | |
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| 32. Journée | 29.04.2016 | SC Paderborn 07 | - | SC Freiburg | 1:2 | ||||
| 33. Journée | 08.05.2016 | TSV 1860 München | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 15.05.2016 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Nürnberg | 0:1 |
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