| 6. Journée | 02.10.2006 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 1:0 |  |
|||
| 7. Journée | 13.10.2006 | MSV Duisburg | - | SC Freiburg | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 18.02.2007 | TSV 1860 München | - | MSV Duisburg | 2:2 | ||||
| 23. Journée | 26.02.2007 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 1:2 | ||||
| 24. Journée | 04.03.2007 | SC Freiburg | - | MSV Duisburg | 2:1 | ||||
| 27. Journée | 02.04.2007 | 1. FC Kaiserslautern | - | MSV Duisburg | 0:3 | ||||
| 28. Journée | 08.04.2007 | MSV Duisburg | - | Kickers Offenbach | 4:0 | ||||
| 29. Journée | 13.04.2007 | FC Augsburg | - | MSV Duisburg | 1:2 | ||||
| 30. Journée | 22.04.2007 | MSV Duisburg | - | Eintracht Braunschweig | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 27.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena | - | MSV Duisburg | 3:3 |
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