| 12. Journée | 20.11.2016 | Pembroke Athleta FC | - | Floriana FC | 1:2 | ||||
| 13. Journée | 27.11.2016 | Balzan FC | - | Pembroke Athleta FC | 4:0 | ||||
| 14. Journée | 03.12.2016 | Pembroke Athleta FC | - | Valletta FC | 0:3 | ||||
| 17. Journée | 08.01.2017 | Birkirkara FC | - | Pembroke Athleta FC | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 22.01.2017 | Tarxien Rainbows | - | Pembroke Athleta FC | 7:1 | ||||
| 21. Journée | 04.02.2017 | Sliema Wanderers | - | Pembroke Athleta FC | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 11.02.2017 | Pembroke Athleta FC | - | Mosta FC | 0:3 | ||||
| 23. Journée | 25.02.2017 | Floriana FC | - | Pembroke Athleta FC | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 05.03.2017 | Pembroke Athleta FC | - | Balzan FC | 2:5 | ||||
| 25. Journée | 11.03.2017 | Valletta FC | - | Pembroke Athleta FC | 4:0 |  |
|||
| 26. Journée | 17.03.2017 | Pembroke Athleta FC | - | Hibernians FC | 0:3 | ||||
| 27. Journée | 01.04.2017 | Gżira United | - | Pembroke Athleta FC | 5:1 | |
|||
| 28. Journée | 04.04.2017 | Pembroke Athleta FC | - | Birkirkara FC | 0:2 | |
|||
| 29. Journée | 09.04.2017 | St. Andrews FC | - | Pembroke Athleta FC | 6:0 | ||||
| 33. Journée | 05.05.2017 | Mosta FC | - | Pembroke Athleta FC | 4:2 |
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