| 1. Journée | 12.08.2012 | RB Leipzig | - | 1. FC Union Berlin II | 1:1 | ||||
| 2. Journée | 26.08.2012 | 1. FC Union Berlin II | - | Energie Cottbus II | 2:2 | ||||
| 3. Journée | 02.09.2012 | FSV Zwickau | - | 1. FC Union Berlin II | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 23.09.2012 | Berliner AK 07 | - | 1. FC Union Berlin II | 0:0 | ||||
| 7. Journée | 07.10.2012 | 1. FC Union Berlin II | - | TSG Neustrelitz | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 21.10.2012 | 1. FC Lok Leipzig | - | 1. FC Union Berlin II | 0:5 |  |
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| 10. Journée | 04.11.2012 | Germania Halberstadt | - | 1. FC Union Berlin II | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 11.11.2012 | 1. FC Union Berlin II | - | VfB Auerbach | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 17.11.2012 | ZFC Meuselwitz | - | 1. FC Union Berlin II | 3:0 | ||||
| 13. Journée | 25.11.2012 | 1. FC Union Berlin II | - | VFC Plauen | 2:2 | |
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| 17. Journée | 24.03.2013 | Energie Cottbus II | - | 1. FC Union Berlin II | 4:1 | ||||
| 16. Journée | 03.04.2013 | 1. FC Union Berlin II | - | RB Leipzig | 1:2 |  |
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| 26. Journée | 27.04.2013 | VfB Auerbach | - | 1. FC Union Berlin II | 2:1 | |
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| 14. Journée | 02.05.2013 | Hertha BSC II | - | 1. FC Union Berlin II | 1:3 | |
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| 18. Journée | 08.05.2013 | 1. FC Union Berlin II | - | FSV Zwickau | 1:3 |
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