| 11. Journée | 28.10.2012 | 1. FC Union Berlin | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 19. Journée | 17.12.2012 | Eintracht Braunschweig | - | 1. FC Union Berlin | 4:3 | ||||
| 20. Journée | 01.02.2013 | 1. FC Union Berlin | - | SV Sandhausen | 3:1 | ||||
| 23. Journée | 23.02.2013 | 1. FC Köln | - | 1. FC Union Berlin | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 01.03.2013 | 1. FC Union Berlin | - | Erzgebirge Aue | 3:0 | ||||
| 27. Journée | 31.03.2013 | FSV Frankfurt | - | 1. FC Union Berlin | 3:0 | ||||
| 29. Journée | 12.04.2013 | 1. FC Union Berlin | - | Dynamo Dresden | 0:0 | ||||
| 30. Journée | 19.04.2013 | VfR Aalen | - | 1. FC Union Berlin | 3:0 | ||||
| 32. Journée | 05.05.2013 | TSV 1860 München | - | 1. FC Union Berlin | 3:0 | ||||
| 33. Journée | 12.05.2013 | 1. FC Union Berlin | - | MSV Duisburg | 2:1 | ||||
| 34. Journée | 19.05.2013 | VfL Bochum | - | 1. FC Union Berlin | 1:2 |  |
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