| 22. Journée | 22.02.2006 | Hamburger SV II | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:0 | ||||
| 25. Journée | 25.02.2006 | Kickers Emden | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 | ||||
| 27. Journée | 11.03.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:2 | ||||
| 28. Journée | 21.03.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 |  |
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| 29. Journée | 25.03.2006 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | |
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| 26. Journée | 28.03.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfB Lübeck | 0:0 | ||||
| 30. Journée | 01.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Bayer Leverkusen II | 3:1 | ||||
| 31. Journée | 08.04.2006 | Hertha BSC II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 32. Journée | 15.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 18.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 22.04.2006 | Chemnitzer FC | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 34. Journée | 29.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 | ||||
| 35. Journée | 06.05.2006 | Holstein Kiel | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 | |
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| 36. Journée | 13.05.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfL Osnabrück | 1:1 |  |
|||
| 38. Journée | 27.05.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Rot-Weiss Essen | 0:1 |
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