| 2. Journée | 11.08.2024 | FC Zlín B | - | SK Uničov | 3:1 |  |
|||
| 3. Journée | 17.08.2024 | FC Strání | - | FC Zlín B | 1:2 | ||||
| 4. Journée | 25.08.2024 | FC Zlín B | - | Hanácká Slávia Kroměříž | 0:2 | ||||
| 5. Journée | 31.08.2024 | TJ Unie Hlubina | - | FC Zlín B | 0:5 | ||||
| 6. Journée | 07.09.2024 | FC Zlín B | - | FK Třinec | 3:1 | ||||
| 8. Journée | 21.09.2024 | FC Zlín B | - | 1. FC Slovácko B | 2:0 | ||||
| 9. Journée | 29.09.2024 | FK Frýdek-Místek | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 05.10.2024 | FC Zlín B | - | FC Slovan Rosice | 3:1 | |
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| 7. Journée | 09.10.2024 | FK Hodonín | - | FC Zlín B | 4:2 | ||||
| 11. Journée | 12.10.2024 | TJ Start Brno | - | FC Zlín B | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 09.11.2024 | FC Zlín B | - | FC Zbrojovka Brno B | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 16.11.2024 | FK Blansko | - | FC Zlín B | 2:4 | ||||
| 18. Journée | 09.03.2025 | FC Zlín B | - | FC Zlínsko | 0:2 | ||||
| 20. Journée | 22.03.2025 | FC Zlín B | - | FC Strání | 3:1 | ||||
| 21. Journée | 29.03.2025 | Hanácká Slávia Kroměříž | - | FC Zlín B | 5:0 | ||||
| 22. Journée | 05.04.2025 | FC Zlín B | - | TJ Unie Hlubina | 0:0 | ||||
| 24. Journée | 18.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Hodonín | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 27.04.2025 | 1. FC Slovácko B | - | FC Zlín B | 1:0 |
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