| 3. Journée | 27.08.1988 | FC Carl Zeiss Jena | - | Hansa Rostock | 2:0 | ||||
| 6. Journée | 24.09.1988 | 1. FC Union Berlin | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |  |
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| 7. Journée | 30.09.1988 | FC Carl Zeiss Jena | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:0 | |
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| 8. Journée | 12.10.1988 | 1. FC Magdeburg | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:2 | |
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| 11. Journée | 12.11.1988 | FC Carl Zeiss Jena | - | BSG Sachsenring Zwickau | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 17.03.1989 | Hansa Rostock | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:0 | ||||
| 18. Journée | 05.04.1989 | BSG Wismut Aue | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 06.05.1989 | Dynamo Dresden | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |
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