| 17. Journée | 12.07.2016 | FK Atlantas | - | Utenis Utena | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 16.08.2016 | FC Stumbras | - | FK Atlantas | 0:2 |  |
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| 23. Journée | 24.08.2016 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 2:1 | ||||
| 25. Journée | 15.09.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 21.09.2016 | Kauno Žalgiris | - | FK Atlantas | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 01.10.2016 | FK Žalgiris | - | FK Atlantas | 0:1 | ||||
| 28. Journée | 16.10.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 0:1 |
Lituanie