| 3. Journée | 18.03.2006 | Júbilo Iwata | - | Kyoto Purple Sanga | 1:1 | ||||
| 4. Journée | 21.03.2006 | Albirex Niigata | - | Júbilo Iwata | 0:2 |  |
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| 5. Journée | 25.03.2006 | Júbilo Iwata | - | Kawasaki Frontale | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 02.04.2006 | Oita Trinita | - | Júbilo Iwata | 1:2 | |
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| 7. Journée | 08.04.2006 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 3:1 | ||||
| 8. Journée | 16.04.2006 | Júbilo Iwata | - | Sanfrecce Hiroshima | 3:0 | ||||
| 9. Journée | 22.04.2006 | JEF United Chiba | - | Júbilo Iwata | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 30.04.2006 | Júbilo Iwata | - | Ventforet Kofu | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 06.05.2006 | Júbilo Iwata | - | Nagoya Grampus Eight | 2:2 | ||||
| 11. Journée | 12.07.2006 | Gamba Osaka | - | Júbilo Iwata | 2:2 | ||||
| 13. Journée | 19.07.2006 | RB Omiya Ardija | - | Júbilo Iwata | 2:1 | |
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| 14. Journée | 22.07.2006 | Júbilo Iwata | - | Cerezo Osaka | 3:1 | ||||
| 15. Journée | 26.07.2006 | Júbilo Iwata | - | Yokohama F. Marinos | 3:1 | ||||
| 16. Journée | 29.07.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Júbilo Iwata | 2:0 | ||||
| 18. Journée | 19.08.2006 | Nagoya Grampus Eight | - | Júbilo Iwata | 3:1 | ||||
| 22. Journée | 09.09.2006 | Júbilo Iwata | - | Albirex Niigata | 7:0 |
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