| 22. Journée | 16.02.2008 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Union Berlin | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 23.02.2008 | 1. FC Union Berlin | - | Kickers Emden | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 16.03.2008 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Union Berlin | 0:3 |  |
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| 29. Journée | 06.04.2008 | Rot-Weiss Essen | - | 1. FC Union Berlin | 0:3 |  |
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| 30. Journée | 12.04.2008 | 1. FC Union Berlin | - | Wuppertaler SV | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 19.04.2008 | Werder Bremen II | - | 1. FC Union Berlin | 1:0 | ||||
| 32. Journée | 26.04.2008 | 1. FC Union Berlin | - | Energie Cottbus II | 0:1 | ||||
| 33. Journée | 04.05.2008 | Hamburger SV II | - | 1. FC Union Berlin | 0:2 | ||||
| 34. Journée | 08.05.2008 | 1. FC Union Berlin | - | Dynamo Dresden | 4:2 | |
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| 35. Journée | 11.05.2008 | SC Verl | - | 1. FC Union Berlin | 2:3 | |
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| 36. Journée | 17.05.2008 | 1. FC Union Berlin | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | ||||
| 37. Journée | 24.05.2008 | VfB Lübeck | - | 1. FC Union Berlin | 3:7 | |
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