| 17. Journée | 13.11.1999 | SV Wehen-Taunusstein | - | Karlsruher SC II | 0:2 | ||||
| 21. Journée | 04.03.2000 | Karlsruher SC II | - | SSV Reutlingen | 0:5 | ||||
| 24. Journée | 25.03.2000 | Quelle Fürth | - | Karlsruher SC II | 2:2 | ||||
| 25. Journée | 01.04.2000 | Karlsruher SC II | - | SC Pfullendorf | 3:2 | ||||
| 26. Journée | 11.04.2000 | SV Darmstadt 98 | - | Karlsruher SC II | 0:0 | ||||
| 27. Journée | 15.04.2000 | Karlsruher SC II | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 20.04.2000 | Karlsruher SC II | - | VfR Mannheim | 3:3 |  |
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| 29. Journée | 30.04.2000 | TSV 1860 München II | - | Karlsruher SC II | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 06.05.2000 | Karlsruher SC II | - | FC Augsburg | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 12.05.2000 | Borussia Fulda | - | Karlsruher SC II | 2:2 | |
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| 32. Journée | 16.05.2000 | Karlsruher SC II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:2 |
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