| 19. Journée | 26.01.2007 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Köln | 1:3 |  |
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| 20. Journée | 04.02.2007 | 1. FC Köln | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 19.03.2007 | Hansa Rostock | - | 1. FC Köln | 1:1 |  |
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| 27. Journée | 01.04.2007 | 1. FC Köln | - | TuS Koblenz | 3:1 | ||||
| 28. Journée | 05.04.2007 | Erzgebirge Aue | - | 1. FC Köln | 0:1 | |
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| 29. Journée | 15.04.2007 | 1. FC Köln | - | SC Freiburg | 0:3 | ||||
| 31. Journée | 29.04.2007 | 1. FC Köln | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:2 |
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