| 5. Journée | 22.08.2020 | FK Tom Tomsk | - | Dinamo Bryansk | 0:2 |  |
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| 7. Journée | 05.09.2020 | FK Tom Tomsk | - | Alania Vladikavkaz | 0:1 |  |
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| 8. Journée | 09.09.2020 | FK Tom Tomsk | - | Tekstilshchik Ivanovo | 0:2 | ||||
| 9. Journée | 13.09.2020 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 19.09.2020 | FK Tom Tomsk | - | Volgar Astrakhan | 1:3 | |
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| 11. Journée | 23.09.2020 | Fakel Voronezh | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | |
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| 13. Journée | 04.10.2020 | Torpedo Moskva | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 09.10.2020 | FK Tom Tomsk | - | Akron Tolyatti | 2:1 | ||||
| 15. Journée | 13.10.2020 | FK Krasnodar 2 | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 17.10.2020 | FK Tom Tomsk | - | Baltika Kaliningrad | 0:1 | |
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| 18. Journée | 28.10.2020 | FK Tom Tomsk | - | SKA-Khabarovsk | 1:2 | |
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| 19. Journée | 01.11.2020 | FK Chayka | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 15.11.2020 | FK Tom Tomsk | - | FK Chertanovo | 1:2 | |
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| 24. Journée | 25.11.2020 | Irtysh Omsk | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |
Russie