| 1. Journée | 06.08.2006 | FC Carl Zeiss Jena II | - | VfB Pößneck | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 20.08.2006 | FC Carl Zeiss Jena II | - | VFC Plauen | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 09.09.2006 | FSV Zwickau | - | FC Carl Zeiss Jena II | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 14.10.2006 | Hallescher FC | - | FC Carl Zeiss Jena II | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 18.11.2006 | Rot-Weiß Erfurt II | - | FC Carl Zeiss Jena II | 1:3 | ||||
| 15. Journée | 03.12.2006 | ZFC Meuselwitz | - | FC Carl Zeiss Jena II | 2:0 |  |
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| 16. Journée | 10.12.2006 | VfB Pößneck | - | FC Carl Zeiss Jena II | 0:0 | |
|||
| 23. Journée | 18.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Hallescher FC | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 22.04.2007 | SV Dessau 05 | - | FC Carl Zeiss Jena II | 0:1 | ||||
| 25. Journée | 28.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | FV Dresden-Nord | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 12.05.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | FC Eilenburg | 0:3 |
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