| 3. Journée | 14.09.2003 | FV Dresden-Nord [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 3:1 | ||||
| 4. Journée | 20.09.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hamburger SV [A-jeun] | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 28.09.2003 | Bremen 1860 [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 0:2 | ||||
| 12. Journée | 06.12.2003 | Werder Bremen [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 5:0 | ||||
| 14. Journée | 21.02.2004 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | VfL Wolfsburg [A-jeun] | 3:1 | ||||
| 15. Journée | 28.02.2004 | Tasmania Gropiusstadt [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 0:2 | ||||
| 16. Journée | 07.03.2004 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | FV Dresden-Nord [A-jeun] | 0:4 |  |
|||
| 17. Journée | 13.03.2004 | Hamburger SV [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 20.03.2004 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Bremen 1860 [A-jeun] | 7:1 | ||||
| 19. Journée | 03.04.2004 | Hannover 96 [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 3:1 | ||||
| 23. Journée | 09.05.2004 | Hansa Rostock [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 4:0 | ||||
| 24. Journée | 15.05.2004 | VfL Osnabrück [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 1:4 |
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