| 13. Journée | 29.01.2017 | Apollon Smyrnis | - | Lamia | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 04.02.2017 | AO Trikala | - | Apollon Smyrnis | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 12.02.2017 | Apollon Smyrnis | - | Aris Saloniki | 2:2 | ||||
| 16. Journée | 18.02.2017 | AO Chania | - | Apollon Smyrnis | 1:4 |  |
|||
| 18. Journée | 25.02.2017 | GS Kallithea | - | Apollon Smyrnis | 1:2 |  |
|||
| 21. Journée | 18.03.2017 | Apollon Smyrnis | - | Anagennisi Karditsa | 2:0 | |
|||
| 22. Journée | 23.03.2017 | Agrotikos Asteras | - | Apollon Smyrnis | 0:1 | ||||
| 23. Journée | 26.03.2017 | Apollon Smyrnis | - | Aiginiakos FC | 4:1 | |
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| 24. Journée | 01.04.2017 | Panserraikos | - | Apollon Smyrnis | 1:2 | ||||
| 25. Journée | 09.04.2017 | Apollon Smyrnis | - | Kissamikos | 1:0 | |
|||
| 26. Journée | 12.04.2017 | Acharnaikos FC | - | Apollon Smyrnis | 0:2 | |
|||
| 28. Journée | 29.04.2017 | OFI Heraklion | - | Apollon Smyrnis | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 14.05.2017 | Lamia | - | Apollon Smyrnis | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 21.05.2017 | Apollon Smyrnis | - | AO Trikala | 0:0 | |
|||
| 32. Journée | 28.05.2017 | Aris Saloniki | - | Apollon Smyrnis | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 04.06.2017 | Apollon Smyrnis | - | AO Chania | 3:0 |
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