| 1. Journée | 02.08.2003 | KFC Uerdingen 05 | - | Wuppertaler SV | 0:3 | ||||
| 2. Journée | 09.08.2003 | Wuppertaler SV | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 3. Journée | 16.08.2003 | SG Wattenscheid 09 | - | Wuppertaler SV | 0:2 |  |
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| 4. Journée | 23.08.2003 | Wuppertaler SV | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 06.09.2003 | Wuppertaler SV | - | Preußen Münster | 2:1 | |
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| 5. Journée | 10.09.2003 | Dynamo Dresden | - | Wuppertaler SV | 3:0 | ||||
| 9. Journée | 26.09.2003 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiss Essen | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 05.10.2003 | Chemnitzer FC | - | Wuppertaler SV | 1:2 | |
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| 11. Journée | 11.10.2003 | Wuppertaler SV | - | SC Paderborn 07 | 0:3 | ||||
| 12. Journée | 18.10.2003 | FC Schalke 04 II | - | Wuppertaler SV | 0:2 | ||||
| 13. Journée | 25.10.2003 | Wuppertaler SV | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 02.11.2003 | Sachsen Leipzig | - | Wuppertaler SV | 4:0 | ||||
| 15. Journée | 08.11.2003 | Wuppertaler SV | - | 1. FC Köln II | 3:0 | |
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| 17. Journée | 22.11.2003 | Wuppertaler SV | - | VfR Neumünster | 1:1 | |
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| 19. Journée | 07.12.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Wuppertaler SV | 0:1 | |
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