| 18. Journée | 01.02.2009 | TSV 1860 München | - | SC Freiburg | 0:2 | ||||
| 19. Journée | 08.02.2009 | 1. FSV Mainz 05 | - | TSV 1860 München | 2:2 | ||||
| 20. Journée | 15.02.2009 | TSV 1860 München | - | Rot Weiss Ahlen | 2:1 |  |
|||
| 22. Journée | 01.03.2009 | TSV 1860 München | - | FC St. Pauli | 5:1 | ||||
| 23. Journée | 08.03.2009 | FC Ingolstadt 04 | - | TSV 1860 München | 2:3 | ||||
| 24. Journée | 13.03.2009 | TSV 1860 München | - | FSV Frankfurt | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 22.03.2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | TSV 1860 München | 1:0 | |
|||
| 26. Journée | 05.04.2009 | TSV 1860 München | - | VfL Osnabrück | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 12.04.2009 | TuS Koblenz | - | TSV 1860 München | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 01.05.2009 | FC Augsburg | - | TSV 1860 München | 3:0 | ||||
| 31. Journée | 08.05.2009 | TSV 1860 München | - | Hansa Rostock | 3:3 |  |
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| 32. Journée | 12.05.2009 | SV Wehen Wiesbaden | - | TSV 1860 München | 0:0 | ||||
| 33. Journée | 17.05.2009 | TSV 1860 München | - | Alemannia Aachen | 1:1 | |
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