| 7. Journée | 14.09.2008 | NK Varteks | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 |  |
|||
| 8. Journée | 21.09.2008 | NK Croatia Sesvete | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 9. Journée | 28.09.2008 | NK Varteks | - | HNK Cibalia | 3:0 | ||||
| 10. Journée | 05.10.2008 | NK Zadar | - | NK Varteks | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 19.10.2008 | NK Varteks | - | HNK Rijeka | 3:3 | |
|||
| 12. Journée | 26.10.2008 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 0:3 | ||||
| 13. Journée | 02.11.2008 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 0:2 | ||||
| 14. Journée | 09.11.2008 | Slaven Belupo | - | NK Varteks | 2:3 | ||||
| 15. Journée | 16.11.2008 | NK Varteks | - | NK Osijek | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 23.11.2008 | HNK Šibenik | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 17. Journée | 30.11.2008 | NK Varteks | - | Dinamo Zagreb | 0:1 | ||||
| 18. Journée | 07.12.2008 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 2:3 | |
|||
| 28. Journée | 26.04.2009 | NK Varteks | - | Dinamo Zagreb | 1:6 | ||||
| 29. Journée | 03.05.2009 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 0:1 | |
|||
| 30. Journée | 10.05.2009 | NK Varteks | - | NK Osijek | 2:3 | ||||
| 31. Journée | 17.05.2009 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 24.05.2009 | NK Varteks | - | NK Inter Zaprešić | 0:1 | ||||
| 33. Journée | 31.05.2009 | NK Croatia Sesvete | - | NK Varteks | 2:1 |
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