| 2. Journée | 28.08.2016 | Rayo Vallecano | - | Real Valladolid | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 02.10.2016 | Rayo Vallecano | - | Cádiz CF | 3:0 | ||||
| 9. Journée | 09.10.2016 | Real Oviedo | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 16.10.2016 | Rayo Vallecano | - | CD Numancia | 3:3 | ||||
| 11. Journée | 22.10.2016 | Rayo Vallecano | - | Girona FC | 1:0 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2016 | CD Tenerife | - | Rayo Vallecano | 3:2 | ||||
| 13. Journée | 05.11.2016 | Rayo Vallecano | - | UCAM Murcia CF | 0:1 |  |
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| 24. Journée | 05.02.2017 | Rayo Vallecano | - | UD Almería | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 12.02.2017 | RCD Mallorca | - | Rayo Vallecano | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 01.04.2017 | Girona FC | - | Rayo Vallecano | 1:3 |  |
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| 33. Journée | 08.04.2017 | Rayo Vallecano | - | CD Tenerife | 1:1 | ||||
| 34. Journée | 16.04.2017 | UCAM Murcia CF | - | Rayo Vallecano | 0:1 | ||||
| 35. Journée | 22.04.2017 | Rayo Vallecano | - | CD Lugo | 2:0 | ||||
| 36. Journée | 01.05.2017 | SD Huesca | - | Rayo Vallecano | 2:0 | ||||
| 37. Journée | 06.05.2017 | Rayo Vallecano | - | Levante UD | 2:1 | |
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| 39. Journée | 19.05.2017 | Rayo Vallecano | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:0 | ||||
| 42. Journée | 09.06.2017 | Sevilla Atlético | - | Rayo Vallecano | 1:2 | |
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