| 24. Journée | 18.02.2006 | Rot-Weiss Essen | - | Wuppertaler SV | 3:2 | ||||
| 25. Journée | 25.02.2006 | Wuppertaler SV | - | 1. FC Köln II | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 28.02.2006 | VfL Osnabrück | - | Wuppertaler SV | 2:2 |  |
 |
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| 28. Journée | 18.03.2006 | Werder Bremen II | - | Wuppertaler SV | 2:1 | ||||
| 23. Journée | 21.03.2006 | Wuppertaler SV | - | SG Wattenscheid 09 | 1:0 | |
|||
| 29. Journée | 25.03.2006 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 28.03.2006 | FC St. Pauli | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 30. Journée | 01.04.2006 | Kickers Emden | - | Wuppertaler SV | 2:0 | ||||
| 31. Journée | 08.04.2006 | Wuppertaler SV | - | VfB Lübeck | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 15.04.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | Wuppertaler SV | 1:1 | |
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| 27. Journée | 19.04.2006 | Wuppertaler SV | - | Hamburger SV II | 1:1 | |
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| 37. Journée | 20.05.2006 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 38. Journée | 27.05.2006 | Wuppertaler SV | - | Chemnitzer FC | 3:1 |
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