| 5. Journée | 27.08.2006 | Dynamo České Budějovice | - | 1. FC Slovácko | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 01.10.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Slovácko | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 04.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | Viktoria Plzeň | 0:2 | ||||
| 15. Journée | 18.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | FK Jablonec 97 | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 26.11.2006 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Slovácko | 2:2 |  |
 |
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| 17. Journée | 02.12.2006 | 1. FC Slovácko | - | Tescoma Zlín | 0:0 |
Slovaquie