| 1. Journée | 02.08.1998 | FC Gütersloh | - | 1. FC Köln | 0:1 | ||||
| 2. Journée | 09.08.1998 | Fortuna Düsseldorf | - | FC Gütersloh | 3:1 | ||||
| 5. Journée | 23.08.1998 | FC Gütersloh | - | Hannover 96 | 2:1 |  |
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| 9. Journée | 04.10.1998 | FC Gütersloh | - | 1. FSV Mainz 05 | 6:1 | ||||
| 10. Journée | 18.10.1998 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC Gütersloh | 3:2 | ||||
| 11. Journée | 25.10.1998 | FC Gütersloh | - | FC St. Pauli | 1:4 | ||||
| 12. Journée | 30.10.1998 | SG Wattenscheid 09 | - | FC Gütersloh | 1:1 | ||||
| 13. Journée | 08.11.1998 | FC Gütersloh | - | Energie Cottbus | 1:1 | |
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| 14. Journée | 16.11.1998 | Karlsruher SC | - | FC Gütersloh | 2:3 | ||||
| 15. Journée | 20.11.1998 | Rot-Weiß Oberhausen | - | FC Gütersloh | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 29.11.1998 | FC Gütersloh | - | Arminia Bielefeld | 0:2 | ||||
| 17. Journée | 04.12.1998 | Fortuna Köln | - | FC Gütersloh | 3:2 | ||||
| 19. Journée | 20.12.1998 | FC Gütersloh | - | Fortuna Düsseldorf | 2:2 | ||||
| 26. Journée | 18.04.1999 | 1. FSV Mainz 05 | - | FC Gütersloh | 1:0 | ||||
| 30. Journée | 16.05.1999 | Energie Cottbus | - | FC Gütersloh | 5:1 |
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