| 1. Journée | 21.07.2012 | Wacker Burghausen | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 2. Journée | 28.07.2012 | Preußen Münster | - | Chemnitzer FC | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 03.08.2012 | SV Darmstadt 98 | - | Preußen Münster | 2:1 |  |
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| 4. Journée | 08.08.2012 | Preußen Münster | - | Hansa Rostock | 5:2 | ||||
| 9. Journée | 15.09.2012 | VfL Osnabrück | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 10. Journée | 22.09.2012 | Preußen Münster | - | Arminia Bielefeld | 4:0 | ||||
| 12. Journée | 29.09.2012 | Preußen Münster | - | Borussia Dortmund II | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 06.10.2012 | 1. FC Saarbrücken | - | Preußen Münster | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 03.11.2012 | Preußen Münster | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:2 | ||||
| 22. Journée | 15.12.2012 | Preußen Münster | - | SV Darmstadt 98 | 3:0 |
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