| 2e tour | 14.02.2013 | BATE Borisov | - | Fenerbahçe | 0:0 | ||||
| 2e tour | 21.02.2013 | Fenerbahçe | - | BATE Borisov | 1:0 | ||||
| tour des 16 | 07.03.2013 | Viktoria Plzeň | - | Fenerbahçe | 0:1 |  |
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| tour des 16 | 14.03.2013 | Fenerbahçe | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| Quarts de finale | 04.04.2013 | Fenerbahçe | - | Lazio Roma | 2:0 | ||||
| Quarts de finale | 11.04.2013 | Lazio Roma | - | Fenerbahçe | 1:1 | |
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| Demi-finales | 25.04.2013 | Fenerbahçe | - | SL Benfica | 1:0 | ||||
| Demi-finales | 02.05.2013 | SL Benfica | - | Fenerbahçe | 3:1 |
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