| 1. Journée | 18.08.2008 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 2:2 |  |
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| 2. Journée | 24.08.2008 | Hansa Rostock | - | Alemannia Aachen | 1:0 | |
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| 3. Journée | 01.09.2008 | SC Freiburg | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 4. Journée | 14.09.2008 | Hansa Rostock | - | 1. FSV Mainz 05 | 2:2 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2008 | Hansa Rostock | - | FC St. Pauli | 3:0 | |
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| 10. Journée | 28.10.2008 | Hansa Rostock | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:2 | ||||
| 11. Journée | 02.11.2008 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 24.11.2008 | Hansa Rostock | - | TSV 1860 München | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 30.11.2008 | FC Augsburg | - | Hansa Rostock | 2:0 | ||||
| 17. Journée | 14.12.2008 | Hansa Rostock | - | SV Wehen Wiesbaden | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 01.02.2009 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 27.02.2009 | Hansa Rostock | - | Rot Weiss Ahlen | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 08.05.2009 | TSV 1860 München | - | Hansa Rostock | 3:3 |
France