| 5. Journée | 03.08.2015 | FK Tom Tomsk | - | Arsenal Tula | 1:3 | ||||
| 6. Journée | 10.08.2015 | FK Tom Tomsk | - | FK Tosno | 3:2 | ||||
| 7. Journée | 17.08.2015 | FK Tom Tomsk | - | FK Torpedo Armavir | 4:0 | ||||
| 8. Journée | 23.08.2015 | FK Tom Tomsk | - | Gazovik Orenburg | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 31.08.2015 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Tom Tomsk | 0:1 |  |
|||
| 10. Journée | 07.09.2015 | FK Tom Tomsk | - | Volgar Astrakhan | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 14.09.2015 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Tom Tomsk | 1:2 | ||||
| 12. Journée | 20.09.2015 | FK Tom Tomsk | - | FK Tyumen | 1:1 | ||||
| 13. Journée | 28.09.2015 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Tom Tomsk | 0:3 | ||||
| 14. Journée | 04.10.2015 | FK Tom Tomsk | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 15.10.2015 | FK Tom Tomsk | - | Volga Nizhniy Novgorod | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 19.10.2015 | Sibir Novosibirsk | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |  |
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| 18. Journée | 25.10.2015 | FK Tom Tomsk | - | Baltika Kaliningrad | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 01.11.2015 | FK Kamaz | - | FK Tom Tomsk | 0:1 | ||||
| 23. Journée | 25.11.2015 | Arsenal Tula | - | FK Tom Tomsk | 1:2 |
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