| 6. Journée | 10.04.1999 | Etoile Carouge FC | - | FC Aarau | 3:1 | ||||
| 7. Journée | 17.04.1999 | FC Aarau | - | BSC Young Boys | 1:1 |  |
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| 8. Journée | 24.04.1999 | BSC Young Boys | - | FC Aarau | 4:1 |  |
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| 9. Journée | 01.05.1999 | FC Aarau | - | Etoile Carouge FC | 3:1 | |
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| 10. Journée | 09.05.1999 | SR Delémont | - | FC Aarau | 2:1 | |
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| 11. Journée | 16.05.1999 | FC Wil 1900 | - | FC Aarau | 2:3 | ||||
| 12. Journée | 22.05.1999 | FC Aarau | - | FC Sion | 4:1 | |
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| 13. Journée | 29.05.1999 | FC Lugano | - | FC Aarau | 1:2 | ||||
| 14. Journée | 05.06.1999 | FC Aarau | - | Yverdon Sport FC | 2:1 |
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