| 1. Journée | 29.07.2006 | Tescoma Zlín | - | 1. FC Slovácko | 1:2 |  |
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| 2. Journée | 05.08.2006 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 0:2 | ||||
| 3. Journée | 13.08.2006 | FK Teplice | - | 1. FC Slovácko | 3:2 | ||||
| 6. Journée | 10.09.2006 | 1. FC Slovácko | - | Slovan Liberec | 0:1 | ||||
| 7. Journée | 17.09.2006 | Slavia Praha | - | 1. FC Slovácko | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 23.10.2006 | 1. FC Slovácko | - | AC Sparta Praha | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2006 | SK Kladno | - | 1. FC Slovácko | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 04.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | Viktoria Plzeň | 0:2 |
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