| 2. Journée | 22.08.1999 | Bayer Leverkusen | - | Bayern München | 2:0 | ||||
| 4. Journée | 11.09.1999 | MSV Duisburg | - | Bayern München | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 24.09.1999 | Bayern München | - | VfB Stuttgart | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 16.10.1999 | Bayern München | - | Hertha BSC | 3:1 | ||||
| 9. Journée | 23.10.1999 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München | 0:2 | ||||
| 11. Journée | 06.11.1999 | SSV Ulm 1846 | - | Bayern München | 0:1 |  |
|||
| 14. Journée | 04.12.1999 | Bayern München | - | Borussia Dortmund | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 09.02.2000 | Bayern München | - | Bayer Leverkusen | 4:1 | ||||
| 20. Journée | 12.02.2000 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München | 0:2 | ||||
| 22. Journée | 26.02.2000 | Bayern München | - | Eintracht Frankfurt | 4:1 | ||||
| 23. Journée | 04.03.2000 | VfB Stuttgart | - | Bayern München | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 11.03.2000 | Bayern München | - | FC Schalke 04 | 4:1 | ||||
| 27. Journée | 01.04.2000 | VfL Wolfsburg | - | Bayern München | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 23.04.2000 | Borussia Dortmund | - | Bayern München | 0:1 | ||||
| 33. Journée | 13.05.2000 | Arminia Bielefeld | - | Bayern München | 0:3 | ||||
| 34. Journée | 20.05.2000 | Bayern München | - | Werder Bremen | 3:1 |
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