| 1. Journée | 04.08.2006 | TeBe Berlin | - | Hansa Rostock II | 4:2 | ||||
| 2. Journée | 13.08.2006 | Hansa Rostock II | - | Torgelower SV Greif | 2:0 | ||||
| 3. Journée | 19.08.2006 | MSV 1919 Neuruppin | - | Hansa Rostock II | 1:3 | ||||
| 4. Journée | 27.08.2006 | Hansa Rostock II | - | Germania Schöneiche | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 13.09.2006 | Hansa Rostock II | - | Türkiyemspor Berlin | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 24.09.2006 | SV Yesilyurt | - | Hansa Rostock II | 2:1 |  |
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| 7. Journée | 30.09.2006 | Hansa Rostock II | - | BFC Preussen | 3:2 |  |
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| 8. Journée | 14.10.2006 | BFC Dynamo | - | Hansa Rostock II | 0:5 | ||||
| 9. Journée | 21.10.2006 | Hansa Rostock II | - | Ludwigsfelder FC | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 29.10.2006 | FV Motor Eberswalde | - | Hansa Rostock II | 1:6 | |
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| 11. Journée | 04.11.2006 | Hansa Rostock II | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 | ||||
| 13. Journée | 18.11.2006 | Hansa Rostock II | - | TSG Neustrelitz | 1:2 | ||||
| 14. Journée | 26.11.2006 | BAK Ankaraspor 07 | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 03.12.2006 | Hansa Rostock II | - | LFC Berlin | 3:0 | |
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| 16. Journée | 09.12.2006 | Hansa Rostock II | - | TeBe Berlin | 2:0 |
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