| 6. Journée | 29.08.2008 | FC Concordia Basel | - | FC Thun | 1:3 | ||||
| 7. Journée | 14.09.2008 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 4:2 | ||||
| 8. Journée | 27.09.2008 | FC Wohlen | - | FC Thun | 2:2 | ||||
| 9. Journée | 06.10.2008 | FC Thun | - | FC Gossau | 4:1 | ||||
| 10. Journée | 25.10.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Thun | 0:2 | ||||
| 11. Journée | 03.11.2008 | FC Thun | - | Yverdon Sport FC | 2:4 | ||||
| 12. Journée | 09.11.2008 | FC Biel/Bienne | - | FC Thun | 3:2 | ||||
| 13. Journée | 15.11.2008 | FC Thun | - | FC Locarno | 2:1 | ||||
| 14. Journée | 29.11.2008 | Servette FC | - | FC Thun | 4:1 | ||||
| 29. Journée | 24.05.2009 | FC Thun | - | Servette FC | 3:0 |
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