| 14. Journée | 11.12.2016 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 18.12.2016 | AE Lárissa | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 1. Journée | 05.01.2017 | Platanias Chanion | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 2. Journée | 09.01.2017 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 15.01.2017 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 16. Journée | 19.01.2017 | Panathinaikos | - | Platanias Chanion | 2:1 | ||||
| 17. Journée | 22.01.2017 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 1:1 |  |
|||
| 18. Journée | 29.01.2017 | Panathinaikos | - | Levadiakos | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 04.02.2017 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 12.02.2017 | Panathinaikos | - | Panetolikos | 4:0 | ||||
| 21. Journée | 18.02.2017 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 0:5 | |
|||
| 22. Journée | 25.02.2017 | Xanthi FC | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 27. Journée | 06.04.2017 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 09.04.2017 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 3:0 |
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